不久之后，王允再次邀请吕布过府，王梓枫也在王允府上，三人谈了很久，王梓枫和王允巧舌如簧，劝说吕布刺杀董卓，细数董卓做得种种恶行，把吕布刺杀董卓的行为说的伟光正至极，弱化二人的父子关系，并且再次强调董卓强抢貂蝉入府，还是在明知吕布喜欢貂蝉的情况下，激起吕布的愤慨，随后又拿出王梓枫授意貂蝉写给吕布的一封信，诉说对吕布的相思之情以及董卓霸占她之后，她的内心有多么的煎熬，多想与吕布长相厮守等等，这封信，是压死吕布的最后一根稻草，他细心的收好貂蝉的信，然后点头同意了二人的劝说，然后三人详细的定下了刺杀董卓的细节，吕布牢记于心。
初平三年192年四月二十三日清晨，正当王允等人准备采取行动的时候，正逢天子大病初愈。朝廷百官在未央宫集合，恭祝天子龙体安康。
事前，吕布派同郡骑都尉李肃等人带领十多名心腹亲兵，穿上宫廷侍卫的服装，潜伏在宫殿侧门两边。
当董卓车队行至北侧门外时，李肃等人持长戟冲出，刺向董卓，董卓自上次被刺杀以后，心生畏惧，朝服内一直身穿铠甲，所以未伤及要害，而李肃刺伤董卓手臂，并将其刺下车来，董卓疾呼：“吕布何在？”
这时候吕布不慌不忙的掏出准备好的诏书，喊道：“奉旨讨伐贼臣！”
直到此时，董卓才发现吕布背叛了自己，大骂吕布：“狗奴才，你敢！”
吕布则率众人上前将董卓当场斩杀。
太师府主薄田景及仆人上前抱住董卓的尸体，吕布又将他们杀死，杀了这三人之后，在场其他的人都不敢动了。
随后，王允立刻让信使前往各政府部门送达赦免诏书，董卓的死讯传出，株连三族，士兵们都高呼万岁，百姓在路上载歌载舞，很多人把珠宝去换成酒肉来庆祝。
董卓被杀后，王允“录尚书事，总朝政，遣使张种抚慰山东”
作为诛杀国贼的首要功臣，接受了百姓和朝廷的嘉奖，王允态度开始发生改变，似乎有些飘飘然起来：“连董卓这样不可一世的大奸贼都死于我的手下，我还有什么可惧怕的呢？”他开始变得居功自傲，每当群臣集会，王允很少像以前那样和大家推心置腹，共同商讨国只大计，而是正襟危坐，面无任何和善之色，慢慢地，群臣也不再像以前那样推崇和拥护他了。
得知董卓被杀，并且被株连三族的时候，董卓旧臣蔡邕正和王允在一起，得知此事后，脸色突然一变，不自觉的叹了一口气，蔡邕就是死在这脸色的表现和叹的一口气上，王允看到蔡邕的表现后，勃然大怒：“董卓祸国殃民，鱼肉百姓的行为不可饶恕，你身为天子的臣子，不为了国家同仇敌忾的讨伐逆贼，反而为其感到可惜，你这不是和其同一个鼻孔出气吗？”
说完，不由蔡邕分辨，直接命人把蔡邕绑了押到廷尉处问罪。
蔡邕为了能继续写成汉史，便陈辞谢罪，自己愿意承受刺剑削足的酷刑以保全余生。
士大夫们都十分同情怜悯蔡邕的遭遇，设法营救蔡邕，可毫无结果，太尉马日磾专程前往王允住处，替蔡邕说情，王允严正拒绝，以汉室司马迁为例，说蔡邕写的汉史会毁谤和诬蔑幼小的天子，因为这既对神圣的道德教化毫无益处，而且还使他们这些人遭到批评和指责，可怜蔡邕冤死狱中，蔡邕死后，朝内士大夫和文武百官议论纷纷，对王允颇有微词，王允这时才感到一丝的后悔。
董卓死后，王允在如何安排和处理他的旧部时，反复无常，态度极不慎重，他先是想全部赦免董卓的部下，吕布也多次相劝王允，希望王允能全部赦免，可继而王允又对群臣解释说：“本来，他们是没有罪责的，只是身不由己，跟随董卓，所以不得已听从董卓差遣，犯了错误。现在如果给他们突然加上叛逆的罪名之后，又特定赦免他们，恐怕反而使他们猜疑恐惧，心理承受不了，所以，赦免他们无罪不是使他们安心的上上之策，还不如让他们承受惩罚，才能让他们安心，以免国之根基不稳。”
吕布又想把董卓的财物赏赐公卿、将校，王允直接拒绝了，王允平日根本看不起吕布，以剑客对待他，认为吕布只是一介莽夫而已，吕布也认为自己有功劳，自吹自擂，得意至极，渐渐与王允与吕布变得不和了。
凉州兵是董卓的嫡系部队，战斗力极强，并且对董卓最为忠心。董卓死后，如何处置凉州兵，是关系王允本人和东汉政权根基的大事。
王允企图削夺凉州兵将领的兵权，取缔全部凉州兵，并且计划利用关东联盟军去控制他们。
可是后来有人对王允说：“凉州兵一直害怕袁绍，畏惧关东联盟军，而今，如果派关东联盟军去解散他们，凉州兵人人都会担心性命不保，这样，很容易引起兵变和混乱。还不如任命皇甫嵩为将军，去担任凉州兵的统帅，并让他长期留在那儿，以便安抚军心。”
王允坚决反对：“这样绝对不行，关东联盟军是反董卓的义兵，与我们是同一条战线，现在董卓已经死了，如果继续把他们屯驻在险恶之地，虽然安抚了凉州兵，但是关东兵将领会疑心我们不重视他们，反而会造成军心不稳。”
王梓枫派暗族成员去凉州散布传言，就说王允要杀掉所有凉州人，一时之间，整个凉州人心惶惶，王梓枫又飞书召回李天命，然后和其赶往凉州，派影雨率领影族潜入曹操率领的军队，派影煞率领影杀组潜入孙坚率领的军队，等待王、李二人进一步的命令。
王、李二人潜入凉州后，第一件事就是安排情报组疯狂散布传言，已是惊弓之鸟的凉州兵索性想道：反正都是一死，还不说索性反了。
初平三年192年四月二十三日清晨，正当王允等人准备采取行动的时候，正逢天子大病初愈。朝廷百官在未央宫集合，恭祝天子龙体安康。
事前，吕布派同郡骑都尉李肃等人带领十多名心腹亲兵，穿上宫廷侍卫的服装，潜伏在宫殿侧门两边。
当董卓车队行至北侧门外时，李肃等人持长戟冲出，刺向董卓，董卓自上次被刺杀以后，心生畏惧，朝服内一直身穿铠甲，所以未伤及要害，而李肃刺伤董卓手臂，并将其刺下车来，董卓疾呼：“吕布何在？”
这时候吕布不慌不忙的掏出准备好的诏书，喊道：“奉旨讨伐贼臣！”
直到此时，董卓才发现吕布背叛了自己，大骂吕布：“狗奴才，你敢！”
吕布则率众人上前将董卓当场斩杀。
太师府主薄田景及仆人上前抱住董卓的尸体，吕布又将他们杀死，杀了这三人之后，在场其他的人都不敢动了。
随后，王允立刻让信使前往各政府部门送达赦免诏书，董卓的死讯传出，株连三族，士兵们都高呼万岁，百姓在路上载歌载舞，很多人把珠宝去换成酒肉来庆祝。
董卓被杀后，王允“录尚书事，总朝政，遣使张种抚慰山东”
作为诛杀国贼的首要功臣，接受了百姓和朝廷的嘉奖，王允态度开始发生改变，似乎有些飘飘然起来：“连董卓这样不可一世的大奸贼都死于我的手下，我还有什么可惧怕的呢？”他开始变得居功自傲，每当群臣集会，王允很少像以前那样和大家推心置腹，共同商讨国只大计，而是正襟危坐，面无任何和善之色，慢慢地，群臣也不再像以前那样推崇和拥护他了。
得知董卓被杀，并且被株连三族的时候，董卓旧臣蔡邕正和王允在一起，得知此事后，脸色突然一变，不自觉的叹了一口气，蔡邕就是死在这脸色的表现和叹的一口气上，王允看到蔡邕的表现后，勃然大怒：“董卓祸国殃民，鱼肉百姓的行为不可饶恕，你身为天子的臣子，不为了国家同仇敌忾的讨伐逆贼，反而为其感到可惜，你这不是和其同一个鼻孔出气吗？”
说完，不由蔡邕分辨，直接命人把蔡邕绑了押到廷尉处问罪。
蔡邕为了能继续写成汉史，便陈辞谢罪，自己愿意承受刺剑削足的酷刑以保全余生。
士大夫们都十分同情怜悯蔡邕的遭遇，设法营救蔡邕，可毫无结果，太尉马日磾专程前往王允住处，替蔡邕说情，王允严正拒绝，以汉室司马迁为例，说蔡邕写的汉史会毁谤和诬蔑幼小的天子，因为这既对神圣的道德教化毫无益处，而且还使他们这些人遭到批评和指责，可怜蔡邕冤死狱中，蔡邕死后，朝内士大夫和文武百官议论纷纷，对王允颇有微词，王允这时才感到一丝的后悔。
董卓死后，王允在如何安排和处理他的旧部时，反复无常，态度极不慎重，他先是想全部赦免董卓的部下，吕布也多次相劝王允，希望王允能全部赦免，可继而王允又对群臣解释说：“本来，他们是没有罪责的，只是身不由己，跟随董卓，所以不得已听从董卓差遣，犯了错误。现在如果给他们突然加上叛逆的罪名之后，又特定赦免他们，恐怕反而使他们猜疑恐惧，心理承受不了，所以，赦免他们无罪不是使他们安心的上上之策，还不如让他们承受惩罚，才能让他们安心，以免国之根基不稳。”
吕布又想把董卓的财物赏赐公卿、将校，王允直接拒绝了，王允平日根本看不起吕布，以剑客对待他，认为吕布只是一介莽夫而已，吕布也认为自己有功劳，自吹自擂，得意至极，渐渐与王允与吕布变得不和了。
凉州兵是董卓的嫡系部队，战斗力极强，并且对董卓最为忠心。董卓死后，如何处置凉州兵，是关系王允本人和东汉政权根基的大事。
王允企图削夺凉州兵将领的兵权，取缔全部凉州兵，并且计划利用关东联盟军去控制他们。
可是后来有人对王允说：“凉州兵一直害怕袁绍，畏惧关东联盟军，而今，如果派关东联盟军去解散他们，凉州兵人人都会担心性命不保，这样，很容易引起兵变和混乱。还不如任命皇甫嵩为将军，去担任凉州兵的统帅，并让他长期留在那儿，以便安抚军心。”
王允坚决反对：“这样绝对不行，关东联盟军是反董卓的义兵，与我们是同一条战线，现在董卓已经死了，如果继续把他们屯驻在险恶之地，虽然安抚了凉州兵，但是关东兵将领会疑心我们不重视他们，反而会造成军心不稳。”
王梓枫派暗族成员去凉州散布传言，就说王允要杀掉所有凉州人，一时之间，整个凉州人心惶惶，王梓枫又飞书召回李天命，然后和其赶往凉州，派影雨率领影族潜入曹操率领的军队，派影煞率领影杀组潜入孙坚率领的军队，等待王、李二人进一步的命令。
王、李二人潜入凉州后，第一件事就是安排情报组疯狂散布传言，已是惊弓之鸟的凉州兵索性想道：反正都是一死，还不说索性反了。